Спеціальний режим з ПДВ, установлений для сільгоспвиробників, регулюється ст. 209 ПКУ. Так, згідно з п. 209.3 ПКУ, якщо сума ПДВ, сплачена (нарахована) сільгосппідприємством постачальникові на вартість виробничих чинників (див. пп. 209.15.1 ПКУ), перевищує суму податку, нараховану за операціями з постачання сільськогосподарських товарів/послуг, то різниця між такими сумами не підлягає бюджетному відшкодуванню та зараховується до складу податкового кредиту наступного звітного (податкового) періоду. Проте, згідно з п. 209.4 ПКУ, при вивезенні сільгосптоварів у митному режимі експорту сільгосппідприємство — виробник таких товарів/послуг має право на бюджетне відшкодування ПДВ, сплаченого (нарахованого) постачальникам товарів/послуг, вартість яких включається до складу виробничих чинників. Таке відшкодування здійснюється у загальному порядку.